由於許多媽媽是職業婦女，為求便利，採配方奶哺餵新生兒，使得牛奶蛋白過敏的罹病率有明顯上升的趨勢，據估計發生率為百分之2.2至5.9左右，加上嚴重者可引起休克，需要提高警覺。
新生兒由於腸道的防衛系統發育仍不成熟，免疫球蛋白分泌極低，加上嬰兒期的胃腸道黏膜的通透性比成人大高，「嬰兒配方」中的來自於乳牛的牛奶蛋白質成為刺激腸道的過敏原。牛奶蛋白質經由不成熟的腸道吸收而進入人體，引起嬰兒免疫系統的過敏反應，尤其是父母雙方有過敏家族史的嬰兒更容易發生。
牛奶蛋白過敏的症狀會在胃腸道、皮膚、呼吸道及行為上出現。攝食過敏性食物後2個小時會發生嘔吐、腹瀉、和肚子痛，嬰兒會在餵奶後哭鬧不安，腹瀉可能從輕度腹瀉到嚴重的影響至營養不良，甚至兩成嬰兒的糞便帶有血絲粘液。臉頰部或皮膚皺摺處長有濕疹，或在身體上長尋痲疹；在行為方面，嬰兒可能拒絕吃奶、哭鬧、生長遲緩等；最嚴重的過敏者可引起休克，這些症狀在避免過敏食物後會獲得改善。
餵食一般嬰兒配方的嬰兒如果出現任何不適，就應考慮是否為牛奶蛋白過敏，發現後應該儘量避免牛奶蛋白的攝取。最好替換的飲食是母奶，一般建議餵食達6個月以上; 只有在無法進行母乳哺育時，才將牛奶蛋白配方，改成「水解蛋白配方」。並不建議替換羊奶或其他動物奶，甚至豆奶配方的奶粉也有一到四成會過敏。
嬰兒的最佳食物就是最天然的母乳，無論是營養層面、免疫促進層面或是預防過敏症都有非常好的效果。
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