國內掀起紅麴熱，尤其是近幾年來國內外研究陸續發現紅麴有降膽固醇、降血壓等功效，漸漸成為健康市場的新寵。也有愈來愈多人在教人如何自製紅麴。市面上紅麴製品更如雨後春筍般推出。可是，把關健康食品的衛生署及研究紅麴的學者卻告誡大家，要小心吃紅麴，這究竟是怎麼回事？
近幾年來紅麴菌逐漸被各國醫學證實含有膽固醇合成抑制劑紅麴菌素K。發現對人體有多種好處，尤其能優先降低導致動脈硬化的壞膽固醇。美國《臨床營養學期刊》在1999年2月發表一篇報導，經過人體試驗，每人每天吃2.4克紅麴粉，8週後LDL明顯降低。長期投入紅麴研究的台大微生物與生化研究所所長潘子明，民國92年發表一種「低膽固醇蛋」，比一般的蛋膽固醇少了14％。而紅麴菌的好處包含降血壓、抗疲勞、防癌、降血糖。
中華民國心臟基金會表示，因此許多心臟病患會向醫師詢問紅麴的效果，讓醫師不堪其擾，更擔心病患誤信吃紅麴食品可降血脂，卻不知混合使用的危險。添加紅麴醃釀的食物對降膽固醇幫助不大，但若紅麴經過純化製成健康食品如膠囊等，再併用司他汀（statin）類降血脂藥物，可能對肝、腎產生副作用，需要降膽固醇的病患，千萬別邊服藥和邊猛吃紅麴健康食品。美國食物藥品管理局（ＦＤＡ）也曾警告，不要任意購買紅麴健康食品。理由是可能含有藥物，對健康有害，而且和其他藥物併用會產生交互作用。另外，葡萄柚汁會讓紅麴菌素K發揮完全效用，血中濃度將提高五到二十倍，因此吃紅麴產品也不宜併葡萄柚汁。
但紅麴實屬一種食品類的營養補充品，可使膽固醇偏高的人們維持正常、健康的膽固醇水平。紅麴眾多的天然成分中，含有一種可抑制肝臟中的膽固醇合成的最佳成分，稱之為HMG-CoA還原酵素之抑制劑，能幫助促進健康的血清膽固醇水平，紅麴同時還含有不飽和脂肪酸也有助於促進健康的血清三酸甘油酯濃度。台大潘子明教授，建議以1ppm（100萬克中含1克）為橘黴素的安全標準值，提醒一般居家環境無法控制溫度、濕度，雜菌繁殖，民眾千萬不要自製紅麴醬，如需購買一定要選擇有通過GMP或CAS認證工廠所生產的產品，才能吃得健康。
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