高壓氧可以用來治療好多種疾病，最早是用來治療潛水夫症，最近更是可用來治療高山症、糖尿病足的傷口癒合也可利用高壓氧；奇美醫院高壓氧科主任牛柯琪並指出，高壓氧甚至針對自律神經也有調整作用，進而可以促進人體新陳代謝。
高壓氧的應用越來越廣泛，許多疾病都可透過高壓氧治療而獲得改善，至於為何高壓氧具有如此的效果呢？牛柯琪主任表示，高壓氧會增加人體熱體克蛋白70，會使身體增加抵抗力，而且會使水蛋白1和5的表現變好，使水蛋白的活性增加，且因人體在發炎反應時，因為氧化會使游離基增加，而高壓氧則是會使清除游離基的酵素活性增強。
牛柯琪主任並指出，由於高壓氧可直接作用於迷走神經中樞，以及反射性地引起迷走神經興奮，使心律減慢，心輸出量減少；所以，高壓氧也能夠對自律神經有調整作用，使交感神經與副交感神經達到平衡，並進而能控制內分泌系統，且有助於末梢血管循環境污染。
人體結構環環相扣，神經系統、內分泌系與血液循環系統出問題，竟都可經由高壓氧來改善；不過，牛柯琪主任說，雖然自律神經失調可以經由高壓氧治療，且在治療後可以促進新陳代謝，精神會變好，但是，會出現自律神經失調必有其原因，有可能是失眠、熬夜、煩惱等，必須要找到原因，加以改善，才是治本之道。
