中醫認為咖啡屬於刺激性的飲料，常把咖啡與辛辣烤炸等刺激性食物歸為一類，容易造成濕熱體質，所以議長痘痘，口乾舌燥的朋友要少喝，咖啡其實是中樞神經興奮劑，有著顯著的提神、醒腦效果，但是飲用過量時又會造成過度亢奮、失眠、心悸。以咖啡的烘培方式咖啡歸屬於「溫性」，咖啡由於可以刺激中樞神經，可促進腦部活動，使頭腦較爲清醒，反應活潑靈敏，思考能力充沛、注意力集中，提高工作效率，咖啡也會刺激交感神經，刺激胃腸份泌胃酸，促進消化、使快速通便。最重要的咖啡因位屬於溫性，可以提升身體新陳代謝率，增加熱能消耗，有助減肥降脂，咖啡有這麼多的好處，所以深受家的喜歡，
研究顯示如果每天喝太多咖啡（比如六杯以上），可能導致上癮，對咖啡的敏感性下降，惡性循環之下又會進一步喝得更多。很多人關心孕婦產婦能否喝咖啡。基於目前的科學證據，一般認為：每天不超過兩杯（大概200毫克咖啡因）還是可以接受的。孕婦超過這個量,會增加流產、早產或者嬰兒體重不足的風險。如果過量飲用咖啡就會變成咖啡成癮者，特別是本身因為長期熬夜、作息不正常、壓力大造成陰虛體質，此時透過咖啡來提神，效果不但不好，還弄壞身體。陰虛體質的人長期喝咖啡容易上火、口乾舌燥、便秘、眼睛痠澀，不但咖啡成癮，提神效果下降。
有些人一喝咖啡就不舒服，又稱為咖啡醉，其實是咖啡中毒或是對咖啡因敏感，大腦對咖啡因敏感性的個人差異很大，容易對咖啡敏感的朋友其實是體質問題，其中脾胃濕熱體質的人，容易胃酸過多，再喝咖啡反而更刺激，胃食道逆流就容易發生，也容易影響中樞神經的傳導導致不舒服的狀況。對於喝咖啡來說，更應該注意的是與藥物的反應。最需要小心的是麻黃鹼，它具有刺激神經興奮的作用。如果加上咖啡，其效果就會大大加強,從而出現“過量服藥”的症狀。而含有麻黃鹼的成分通常都在感冒藥裡面，所以吃感冒藥不要配咖啡。
一般而言，兒童對咖啡因比成人更為敏感。考慮到回避副作用對兒童更加重要，所以建議兒童最好不要喝咖啡。除了注意體質，想要喝咖啡促進健康，建議選擇咖啡因少、盡量不含人工添加物的黑咖啡，為了健康著想，建議可以鮮奶取代奶精，糖分減量，以免抵銷咖啡原有的好處，而糖尿病患者建議改喝低咖啡因咖啡，至於高血壓患者，則要注意喝咖啡的時間，儘量避免一早起床就灌飲咖啡，避免血壓一時升太高，影響健康。
