水煎藥效果通常會比濃縮中藥好，濃縮中藥的緣由是來自現代人的忙碌，因此發明出服用與攜帶方便的濃縮中藥，也就是俗稱的科學中藥。它的本質是利用傳統水煎藥水，在低溫低壓的環境中將水分蒸乾，然後再製成粉末狀而成，而服用時再配白開水還原，照理來說應該與水煎藥效果相同，那為什麼有些人會說水煎藥效果比濃縮中藥好？其實原因在於有效成分「抽出率」的高低。科學中藥濃縮後再以一定比例的處方藥材、加入生藥粉末、乳糖、結晶性纖維、纖維素及澱粉等賦形劑，中藥濃縮後添加程度不一的賦形劑稀釋至 5～10 倍，而中藥水煎煮出來就是藥材原有的濃度，沒有稀釋，所以水煎藥是科學中藥的5～10 倍的濃度。許多中醫師為了使療效顯著、避免病情惡化、及患者要求病程能迅速恢復所以才開立水藥煎劑給予民眾，同樣是７天份的醫藥費，要價高達2~3千元，容易讓一般民眾吃不消。中藥的使用與對症用藥、中藥劑量的高低、和療效之間、與患者的本身恢復能力，都有絕對的關係。

中醫師因為辯證的觀點不同，即使同樣是開水藥湯劑，處方大小與劑量並沒有一定的標準，有人一張處方僅有3~7味藥，總重1~2兩；相反地，一張處方用了20-30味藥，總重8~10兩的也所在多有，但是科學中藥因為健保以及包裝的關係，藥量不見得可以太多，但是20-30味的中藥卻可以農所在一小碗湯劑裏頭，這也是水煎藥效果好但是需要的費用高的原因，應該先看看疾病的類型與病患的需求，再決定最適合使用哪種劑型。

水煎藥的成分可以「客製化」依照個人體質與症狀增減，因此可以達到比較好的療效；不過現代人生活型態已經改變，如果真的不方便自行熬煮，有些診所也會提供已經煮好的即飲包，和科學中藥互相搭配服用，而日常中的感冒，腸胃炎等症狀單純的疾病用科學中藥綽綽有餘，但是一旦遇到證型較為複雜的患者，常感覺科學中藥使用起來，療效緩慢、症狀沒動靜、或病情一直在惡化，就是適合開水煎劑的時候，而長期使用西藥導致體質不易根動的皮膚病，免疫系統疾病，婦科疾病，水煎藥更是有其使用的必要，如果僅服科學中藥粉，容易有病重藥輕的情形，僅能緩解部份症狀，卻不能修復體質，才會造成症狀反復發作的情形。水煎藥是提供患者較快恢復正常體質的方法，但是因為沒有健保給付，還是必須由患者自行決定，一旦體質恢復正常之後，，服用健保中藥粉也可以鞏固其療效。

針對消費者擔心的中國大陸中藥材安全性問題，其實行政院衛生署自 2004 年即提出「建構中藥用藥安全環境」第一期計畫，以建立中藥品質科學化之評估標準，實施中藥材包裝標示、中藥材重金屬、農藥殘留、微生物等檢測規範，執行以來已大大降低中藥材誤用混用之情形；而目前「第二期（2010～2014）建構中藥用藥安全環境計畫」也持續為中藥用藥安全把關。

此計畫朝中藥材管理三階段之時程加緊實施管控：第一階段為推動中藥材之包裝標示，以確認產品責任歸屬；第二階段為針對重金屬、異常物質及黃麴毒素等，陸續訂定公告各項限量標準，以確保中藥材之使用安全衛生；第三階段則致力完備中藥材之源頭管理機制，對進口產品文書認證及落地追蹤等工作加以落實持續推進。

衛生署中醫藥委員會推動「中藥材包裝標示」，規定 324 種常見中藥材的包裝必須標示品名、重量、製造日期、保存期限，還有製造商、進口商、販賣商的名稱及地址，以確認產品責任歸屬，一旦消費者發現問題，就可立即追溯源頭；此外國內的濃縮中藥也都通過 GMP（藥品優良製造規範）認證的藥商所生產，所有製造流程都有控管，對於重金屬、生菌素等微生物都有安全規範，民眾可不必過於擔心。